Ngày 21/8/2025, tại Hà Nội, Đảng bộ Bộ Giáo dục và Đào tạo tổ chức Đại hội đại biểu lần thứ I, nhiệm kỳ 2025-2030. Ủy viên Trung ương Đảng, Ủy viên Ban Thường vụ Đảng ủy Chính phủ, Phó Thủ tướng Chính phủ Lê Thành Long dự và phát biểu chỉ đạo Đại hội.
Đại hội đã công bố Quyết định của Đảng ủy Chính phủ chỉ định Ban Chấp hành Đảng bộ Bộ Giáo dục và Đào tạo khóa I, nhiệm kỳ 2025-2030 gồm 29 đồng chí; Ban Thường vụ gồm 8 đồng chí.
Đồng chí Nguyễn Kim Sơn, Ủy viên Trung ương Đảng, Bí thư Đảng ủy nhiệm kỳ 2020-2025, Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo giữ chức Bí thư Đảng ủy Bộ Giáo dục và Đào tạo nhiệm kỳ 2025-2030.
Các đồng chí: Phạm Ngọc Thưởng, Phó Bí thư Thường trực Đảng ủy nhiệm kỳ 2020-2025, Thứ trưởng Thường trực Bộ Giáo dục và Đào tạo; Nguyễn Viết Lộc, Phó Bí thư Đảng ủy chuyên trách, nhiệm kỳ 2020-2025 được chỉ định làm Phó Bí thư Đảng ủy Bộ Giáo dục và Đào tạo nhiệm kỳ 2025-2030.
Tháng 9/2025, đồng chí Hoàng Minh Sơn, Thứ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo được  điều động, bổ nhiệm giữ chức Chủ tịch Hội đồng, Giám đốc Đại học Quốc gia Hà Nội.